市房杉

　市房山神宮までの登山道に林立している巨大な市房杉は「市房山神宮の信者が挿し木にとって植えた」と言い伝えられています。
　参道の長さ約１０００ｍ中、幹回り３ｍ以上のものが４３株あり、内訳として、３ｍ以上が６株（鳥居より手前に多い）、４ｍ以上が７株（八丁坂付近に多い）、５ｍ以上が２１株、６ｍ以上が７株、７ｍ以上が１株、８ｍ以上のものが１株あります。この市房杉の樹齢は、小株は５００年〜６００年、大株は１０００年を超えると言われております。
　また、昭和４３年１１月１４日に完成した皇居新宮殿の天井板に２本献上されております。

平安杉

　市房山を代表する杉として、市房山神宮の建立年（807年）が平安時代であったことから命名されました。幹が途中で分岐せずに美しい樹形が保たれている杉としては、市房山で幹回り最大の杉です。心身の浄化・健康・長寿のご利益があるとされています。

双子杉

　幹周り８ｍを超える市房山最大の杉です。幹の途中から二股に分かれているため命名されました。二股に分かれた幹が協力して、１本の木を力強く支えている様は、団結力、協調性を連想させ、ビジネス・スポーツなどの勝利にご利益があるとされています。

夫婦杉

　市房杉のシンボル的存在であった夫婦杉は、２本の巨木が寄り添うように風雪に耐えている姿から「夫婦杉」と呼ばれ、この前で結婚式を挙げるなど縁結びの神様としても親しまれ、また、地域の誇りともなっていました。
　しかし、その夫婦杉は平成５年８月９日（１９９３年）から１０日に接近した台風７号により、幹が折れる被害を受け、平成６年１月２０日多良木営林署と市房神社関係者の手で切り倒され、その歴史に幕を閉じました。
　その存在があまりにも大きかったことから跡地に夫婦杉からとった苗木を植え、２代目夫婦杉として後世に残すことにしました。

初代夫婦杉の大きさ	男杉	女杉
胸高幹回り	７．０２ｍ	６．５７ｍ
樹高	３７ｍ	３７ｍ

新夫婦杉

　地元では「お嶽さん」と親しまれ、古くから縁結びの神として知られる市房山神宮。その市房山神宮の象徴として大切にされてきた夫婦杉が平成5年の台風で倒れたため、その後継として命名されたのが新夫婦杉です。初代夫婦杉と同じく良縁・夫婦円満と言った縁結びとしてはもちろん、子宝に恵まれるともされています。

千手観音杉

　八丁坂を登りきった石段から振り返ると見える杉で、左右にたくさん伸びた枝が、まるで千手観音を思わせることから命名されました。所願成就にご利益があるとされています。

ツクシアケボノツツジ

　市房山中腹から山頂にかけて自生し、５月上旬から中旬の満開時には、明るく美しい淡桃色となり登山者を楽しませてくれるこのツツジは，熊本県指定の天然記念物になっています。水上村史には「昭和６年に今までのアケボノツツジと異なる新しい変種として公表された」と書かれています。葉の多くは、枝の端に５枚輪状になっており、形は楕円形で長さは２．５ｃｍから４．５ｃｍくらい、枝には毛がなく、花は濃い桃色で１〜２個ずつつき、雄しべは１０本で雌しべの子房には毛は無い。

シャクナゲ

　派手で大きな花が特徴的な常緑低木。光沢のある葉っぱを持ち、花は漏斗状の合弁花で、枝先に球状に咲きます。花の色は白や赤系統が多いですが、黄色いシャクナゲも存在します。

ガクアジサイ

　アジサイの原種で、高さは１．５〜２ｍほどあります。
　中央に沢山の小さな両性花が密集し、その周りを装飾花が囲むように咲きます。
装飾花はおしべとめしべが退化している中正花であり、花びらに見えるものが萼（がく）です。

ヒカゲツツジ

　ヒカゲツツジは関東以西の本州、四国、九州に分布するツツジ科の常緑低木です。高さは１〜２ｍになり、和名の由来にもなった山地の崖や岩の上といったやや日当たりの悪い場所で生育しています。
　樹皮は灰褐色または灰白色をしており、薄片となり剥げ落ちます。
　葉は長さ４〜８ｃｍの長楕円形で、枝先に輪生状に集まってつきます。表面は濃緑色、裏面は淡黄緑色で腺状鱗毛が密にあります。
　４〜５月頃、枝先に漏斗状鐘形の淡い黄緑色の花を２〜５個、咲かせます。大きさは５ｃｍ程で花冠は５中裂し、外面と子房に腺状鱗毛があります。

ゴイシツバメシジミチョウ

　シジミチョウ科の翅の開長１ｃｍ余の小さな蝶です。１９７３年（昭和４８年）８月６日、市房山麓で小林隆史氏によって日本で初めて発見されました。翌年の７月２０日に九州大学教養部の白水隆教授の調査隊によって生態が明らかにされ、１９７５年２月（昭和５０年）種指定の国の天然記念物に指定されました。日本での発見を機に市房山産に白水教授より「ゴイシツバメシジミ」と命名されました。
　この蝶は中国、インドなどで発見されており、今から２００万年以上前、日本がまだ大陸の一部だった頃の残存動物で、一属一種のシジミチョウ科の珍種と言われています。
　現物標本は、中央公民館に保管されています。